スタンダードプログラム（Ａコース）

大学病院から研修をスタートするプログラムです。豊富な指導体制の下、まずはじっくりと学びます。
１年次の特徴として内科、救急のほかに麻酔科２ヶ月間も必修科目となっていることがあげられます。２年次は協力病院または大学病院で研修します。

スタンダードプログラム（Bコース）

市中病院（協力病院）から研修を始めるプログラムです。（１年次に大学病院を選択することも可能です。）
地域第一線の現場で豊富な症例と向き合い、まずは実践力を養い、２年次は大学病院で研修します。

周産期重点プログラム（小児）

小児診療をしっかりと学びたい方向けのプログラムです。１年次は大学病院と市中病院（協力病院）のいずれかで研修し、２年次は大学病院で研修します。大きな特徴は、２年次必修科目の救急と地域医療を福井愛育病院で研修することです。

周産期重点プログラム（産科）

産婦人科診療をしっかりと学びたい方向けのプログラムです。１年次は大学病院と市中病院（協力病院）のいずれかで研修し、２年次は大学病院で研修します。大きな特徴は、２年次に大学病院で周産期診療部（産科・ＮＩＣＵ）が２ヶ月間必修科目となっていることです。

基礎研究医プログラム

臨床研修と基礎研究の両立を目指すプログラムです。他のプログラムと同様、必修科目を大学病院で研修します。大きな特徴は、基礎医学教室で２４週のローテートを行い、基礎研究や論文指導を受けることができます。

※一般外来研修は、総合診療科、内科または地域医療研修時に並行研修にて行う。

歯科臨床プログラム

４～５月は基本研修として、医局・外来・ 病棟のオリエンテーション、病棟勉強会、ファントム実習、相互実習、症例検討会、英語論文抄読会などを行います。
６月以降は、応用研修として、基本研修に加え、副直（当直担当と2名体制）、外来患者担当、入院患者担当が割り当てられます。

（参考）歯科医師臨床研修の到達目標